萝卜菌核病在田间和贮藏期均可发生,主要为害肉质根和叶片,苗期和成株期均可染病。在田间发病,植株地上部根茎处腐烂,地下肉质根软化,组织腐朽呈纤维状,中空,病部外生白色棉絮状菌丝和黑色鼠粪状菌核。发病部位多呈褐色水渍状腐烂,湿度大时,病部表面密生棉絮状白色菌丝体及菌核,菌核初为白色,后逐渐变成黑色鼠粪状。苗期染病,在茎基部出现水渍状的病斑,而后腐烂或猝倒。根茎染病,主要发生在茎基部或分枝的叉口处,产生水浸状不规则形病斑,扩大后环绕根茎一周,淡褐色,边缘不明显,病部长出一层白色棉絮状菌丝体,后期病部可见黑色鼠粪状菌核。叶片、叶球或叶柄染病,发病初始产生水浸状,扩大后病斑呈不规则形,淡褐色,边缘不明显,呈湿腐状。田间湿度高时,病部产生一层白色棉絮状菌丝体及黑色鼠粪状菌核。发病初期,肉质根表面产生污垢状斑点,随着病程延长斑点扩展成不规则形、水浸状、褐色病斑。病斑多在肉质根。