苗期至采收期或贮藏期均可发生，主要危害肉质根、叶片、叶柄及茎。叶片染病，形成暗褐色斑，严重的致叶片枯死。叶柄上病斑长条状。茎上多为梭形至长条形斑，病斑边缘不明显。湿度大时表面密生黑色霉层。肉质根染病多在根头部形成不规则形或圆形稍凹陷黑斑，严重时病斑扩展，深达内部，使肉质根变黑腐烂。幼苗期发病子叶呈水浸状，根髓变黑腐烂。叶片发病，叶缘多处产生黄色斑，后呈现V字形病斑，叶脉变黑呈网纹状，叶缘变黄，后扩及全叶变黄干枯。萝卜黑腐病病菌会沿叶脉和维管束向根部发展。根部发病，导管变黑，内部组织干腐，外观往往看不出明显症状，但髓部多成黑色干腐状，最后形成空洞。该病腐烂时不臭，可区别于软腐病。但有时田间可并发软腐病，呈腐烂状。萝卜肉质根黑心常有发生，影响商品品质。严重时失去食用价值。症状识别地里刚起出的萝卜和窑内贮藏的萝卜都可能出现肉质根发黑的现象。切开萝卜可见肉质根木质部一些薄壁细胞变黑，而出现许多黑色小点，类似于黑芝麻样，如火龙果性状。最先出现于接近表皮部分，严重后连成片，最后整个组织发黑坏死，不能食用。黑心萝卜，有时在肉质根表面也出现灰黑色或黑色斑块，无光泽，从外观上严重影响萝卜商品性状。
