大蒜细菌性软腐病在发病初期，可用72%农用链霉素或新植霉素等药剂，喷雾防治，隔7-10天喷1次，连喷2-3次。重点喷雾发病中心和发病四周附近。选用优良品种、选择适宜地块儿、施腐熟有机肥和化学防治，每亩用72%农用链霉素3000-4000倍液，或47%加瑞农750倍液防治。发病初期喷洒77%氢氧化铜可湿性微粒粉剂500倍液，或50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、14%络氨铜水剂300倍液、72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，隔7～10天1次，视病情连续防治2～3次。清洁田园及时清除病残体，实行轮作，避免连坐。在发病初期开始喷药保护。药剂可用72%农用硫酸液链霉素可溶性粉剂4000倍液，喷雾防治。
