脐橙常见病虫害有溃疡病、疮痂病、树脂病、脐黄病、红蜘蛛、锈壁虱、潜叶蛾、蚧壳虫、粉虱等。主要柑橘害虫包括矢尖蚧、黑点蚧、吹绵蚧、红蜡蚧、全爪螨、始叶螨、锈螨、瘤螨、大实蝇、橘瘦蚊、黑刺粉虱、潜叶蛾、凤蝶、橘潜叶甲、恶性叶甲、吉丁虫、褐天牛、星天牛、枯叶夜蛾等。病害有病毒病（16种）、疮痂病、黑点病、白星病、炭疽病、黑斑病、黑星病、灰霉病、溃疡病、雀斑病、白粉病、拟黄斑病、日本菟丝子、附生性绿球藻、脚腐病、树脂病、流胶病、根朽病、紫纹羽病、白纹羽病、膏药病、干枯病、青霉病和绿霉病等。药剂防治可采用营养钵育苗，移栽时用双多悬浮剂（西瓜重茬剂）300～350倍液灌穴，每穴0.5千克，每667平方米用药1千克；对直播的在播种和丝瓜5～6片真叶时分别灌双多悬浮剂600～700倍液，每穴灌对好的药液0.5千克，每667平方米两次用药1千克。
