发病初期，及时清除病株残体，病果、病叶、病枝等，并可选用500克/升异菌脲悬浮剂375-750克/公顷、400克/升嘧霉胺悬浮剂375-562克/公顷、50%啶酰菌胺水分散粒剂250-350克/公顷喷雾，每隔5-7天一次，连续2-3次，交替使用。合理密植，调节湿度、温度，增加光照，适当通风。发病初期选择腐霉利、扑海因等药剂交替用药防治。
症状主要危害花和果实。发病条件：病菌随病残体存活，菌核体可以在土壤中越冬。防治方法：首先调控好温室内的温湿度，利用温室封闭的特点，创造一个高温、低湿的生态环境条件，控制灰霉病的发生与发展。其次实行轮作，增施有机肥料，合理肥水，调控平衡营养生长与生殖生长的关系，促进瓜秧健壮。再次注意及时喷药保护和防治，每次灌水之前，必须事先细致喷洒防病药液保护植株不受病菌侵染。最后及时摘除开败的花冠，防止感染灰霉病。