大葱锈病主要危害叶片和花梗,症状表现为椭圆至纺锤形的小疮疱,中部呈桔色,周围为黄白色,有光泽。后期这些疮疱会纵裂,周围表皮翻起,散出铁锈色粉末(夏孢子)。严重时,葱叶上会布满病斑破裂后留下的疤痕,导致植株易枯死和腐烂。