选择抗病品种是预防辣椒炭疽病发生最有效的方法，合理密植，加强通风透光，试验表明，选择高抗病品种，可显著降低炭疽病的发生程度。防治辣椒炭疽病，首先要选种抗病品种、做好种子消毒、培育无病壮苗，其次要合理轮作倒茬、建立科学合理的耕作制度，第三要加强田间管理、控制田间湿度、防止田间积水，第四要在初发病时用抗生素和铜制剂田间交替喷雾防治。用50%多菌灵可湿性粉剂（500倍液）+20%氟硅唑咪鲜胺（800倍液）进行喷施。根据地区气候条件，用阿米妙收、拿敌稳等提前预防。发病初期，用50%多菌灵可湿性粉剂或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液喷雾防治。保护地栽培可以每亩用45%百菌清烟剂250克熏蒸防治。
