辣椒早疫病是由半知菌亚门链格孢属茄链格孢菌侵染所致的真菌性病害，以菌丝体及分生孢子随病残体在田间或种子上越冬，第2年产生新的分生孢子，借助风、雨水、昆虫等传播。病菌从气孔或伤口侵入，也可从表皮直接侵入，潜育期3～4天，病部产生大量分生孢子进行再侵染。当秧苗老化衰弱、过密、湿度过大、通风透光不良等都容易发生病害。定植过迟，土壤潮湿，透气不良等会加速病害蔓延。
辣椒疫病全生育期均可发病，现已成为辣椒生产上的主要病害之一。一般田块死株率达到30%，发病严重的达80%，造成毁灭性损失。发病症状表现为辣椒整个生长期都会受到疫病的危害，茎、叶、果实均可染病。苗期发病时，茎基部呈暗绿色水浸状软腐或猝倒，茎基部呈黑褐色，幼苗枯萎而死。