芹菜软腐病主要危害叶柄基部。苗期染病，出现心叶坏死腐烂，呈烧心状。成株期主要发生在叶柄基部、茎基部和茎上。发病初期出现水渍状淡褐色纺锤形或不规则形的凹陷病斑，后迅速扩展，呈黄褐色或黑褐色，内部组织腐烂并有恶臭味，干燥后变黑色，最后仅残留表皮和维管束，严重时生长点烂掉下垂，全株枯死。
芹菜软腐病又称腐烂病，是由胡萝卜软腐欧氏杆菌胡萝卜软腐致病型侵染所引起的、发生在芹菜上的病害。在中国各地均有发生。中国上海及长江中下游地区芹菜软腐病的主要发病盛期在5-11月。一般发病率在5-10%，严重时可达30%以上。
芹菜软腐病是日光温室芹菜生产中常见病害之一。一般先从柔嫩多汁的叶柄基部开始发病，发病初期出现水渍状，形成淡褐色纺锤形或不规则的凹陷斑，后呈湿腐状，变黑发臭，仅残留表皮。病菌主要在土壤中越冬，通过昆虫、雨水或灌溉水等从伤口侵入，发病后可通过雨水或灌溉水传播蔓延。