萝卜黑斑病可采用合理轮作、施农家肥或有机肥、提高抗性、选用抗病品种、杀毒矾喷药等措施。用苯醚甲环唑、噁酮锰锌、戊唑醇或者嘧啶核苷类抗菌素等药剂进行防治；及时清除田间残枝败叶；雨后及时排水；选择耐病品种。从无病区和无病植株上采种。大面积轮作，收获后及时翻晒土地，清洁田园，减少菌源。增施腐熟有机肥，加强管理，提高萝卜抗病力和耐病性。种子消毒，在播种前用种子量0.2%-0.3%的50%异菌脲、75%百菌清、50%腐霉利或50%福美双可湿性粉剂拌种，对周围无十字花科越冬越夏寄主地区可取得一定防效。化学防治，发病初期可选用47%春雷·王铜可湿性粉剂1000倍液，或1：3：400波尔多液、10%多抗霉素可湿性粉剂1000倍液、50%乙烯菌核利可湿性粉剂1000-1500倍液、75%百菌清可湿性粉剂500倍液，7天喷一次，连喷3-5次。
