病菌在病残体上越冬，借助气流和雨水传播。多在拱棚栽培的地块发生，露地栽培的菠菜很少发病。病菌在1-30℃均可侵染，低温高湿条件下易发生；温度15-20℃，湿度95%以上，遇到连续阴雨天气，或者种植密度较大，通风透光条件差田块，灰霉病极易大流行。病菌喜温暖潮湿的环境，适宜发病的温度范围为2-31℃，最适发病环境温度为18-25℃，相对湿度持续90%以上。病菌还可危害番茄、茄子、菜豆、辣椒、韭菜、洋葱、菜豆和莴苣等作物。病菌以分生孢子、菌丝体或菌核随病株残余组织遗留在田间越冬。在环境条件适宜时，分生孢子借气流、雨水反溅、农事操作及病健部间的接触等，传播蔓延至寄主植物上，从伤口、薄壁组织侵入，残花是最适合的侵入部位，引起初次侵染，并在受害的部位产生新生代分生孢子，进行多次再侵染，加重危害。早春多雨、光照不足、低温高湿的年份发病重；秋季多雨、多雾的年份发病重；田块间连作地、地势低洼、排水不良的田块发病较重；栽培上种植过密、通风透光差、肥水施用过多、棚室通风换气不足、长势衰落的田块发病重。低温、高湿，高温、高湿、连阴雨及结露持续时间长，早春多雨或霉雨来早、气候温暖空气湿度大；秋季多雨、多雾、重露或寒流来早时易发病。
