菠菜枯萎病菌主要随植株病残体在土壤中或种子上度夏或越冬。种子可带菌，未腐熟的粪肥也可带菌。病菌可随雨水及灌溉水传播，从根部伤口或根尖直接侵入，侵入后可到达维管束。在维管束中，病菌产生有毒物质，堵塞导管，导致叶片萎黄枯死。高温多湿有利于发病；土温30摄氏度左右、土壤潮湿、肥料未充分腐熟、地下害虫多、线虫多易发病。
防治方法：
1、与葱蕊类、禾本科作物实行3-5年轮作，避免连作；
2、施用日本酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥，并采用配方施肥技术，提高寄主抗病力；
3、采用高畦或起垄栽培，雨后及时排水、严禁大水浸灌；
4、发现中心病株及时拔除，病穴及四周淋50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，40%多硫悬浮剂500倍液，或10%治萎灵水剂300-400倍液，隔半个月喷一次，连续2-3次。
