蒜苗出土后有些新叶会发黄枯死，还有些蒜头的茎盘由饱满变得干瘪。这是种蝇、蓟马、潜叶蝇及咖啡豆象为害造成的，有关防治措施如下：
种蝇幼虫为乳黄色的蛆，体长0.7—0.9cm，尾部有7对肉质突起。幼虫在地下为害大蒜鳞茎，致使蒜头组织逐渐溃烂，心叶因失去养分而发黄，严重的整株枯死。应对已发生种蛆田块的追肥由各类粪肥改为精制有机复合肥或多元复合肥；还要用90%晶体敌百虫1000倍液喷洒，发现蒜头成团枯死的地方，集中用1000倍的90%晶体敌百虫液灌根；对排灌方便的地方，可连续灌水2—3次，每次24小时，使地蛆窒息而死，灌后迅速排水。
蓟马为害大蒜的多为葱蓟马，常在秋冬温暖干旱季节发生。成虫和若虫体长细小，淡黄色或深褐色。一般在大蒜叶处及叶鞘上吮吸汁液，使叶色褪淡，光合作用受损。可用40%乐果乳油1000—2000倍液喷雾，亩用药液50kg；也可用20%氰戊菊脂，每亩用10—25ml，兑水50kg喷雾。
潜叶蝇幼虫似筒状小蛆，多在秋后和次年4月为害。幼似筒状小蛆，多在秋后和次年4月为害。幼虫潜入叶片内蚕食叶肉，使叶面上呈现出灰白色弯曲道，应清除田间受害的大蒜残叶，将其沤肥或烧毁，以减少虫源扩散；可用40%乐果乳剂3000倍液或80%敌敌畏乳剂2000倍液喷雾；也可用高效无残毒的生物农药，即2%苏阿维可湿性粉剂，每亩用50—60g，兑水50kg喷雾；用2.5%溴氰菊脂3000倍液喷雾也可。
咖啡豆象调运大蒜种子时，要严格进行检疫，凡被咖啡豆象为害的蒜种不能调入；蒜种进仓贮藏时，要采用溴溴甲烷等药在仓内进行熏蒸，使咖啡豆象中毒而死。
