牡丹花为肉质根，浇水不宜多，通常情况下冬季不浇水，其他时间浇水根据天气状况和盆土的情况进行。若天气较为干燥，可以适当浇水，但盆土宜干不宜湿。遇到阵雨或者阴雨连绵天气，注意盆内不要积水，以免损害植株。暴雨过后要及时松土，改善土壤的通气状况。
盆栽牡丹浇水以软水为主，天然水是植物的最爱，其次树河塘水。家中的自来水要晾上一天之后在使用。不要用刷碗水或洗衣服的水用来教=浇花，不然牡丹会长得很难看。
注意水温，不要忽冷忽热，最好用常温水。夏季不要用冰水，冬季浇水在室内放置一段时间，让水温与室温相近后使用。
浇水时间和浇水量也要适当的控制，春季可以多浇点水，时间集中在中午；夏天浇水要足，早晚进行；秋冬浇水要少，晴天温度高的时候进行。