水稻遭遇洪涝灾害后，应采取以下措施：
1.及时清洗稻苗上的污物和稻田中的污物，增强光合能力。在退水时随水流方向且抢在秧苗刚刚露尖时及时洗去叶表的泥垢，促进秧苗及早进行光合作用。受淹大田，也应涝去飘浮物，洗去沾在稻叶上的泥沙杂物，对稻苗恢复生机效果良好。
2.适当控制水层，既要防止青枯死苗，又要改善根际环境促进根系活力。淹没后的水稻植株，根系黑根增多、根系活力明显下降，应以增加土壤透气性，改善根际环境为主要目标。高温晴天不能立马排干水，白天保持足够水层严防萎蔫枯苗；秧苗田应在下午5时后排干水露田，待第二天清晨再重新灌浅水，促进根系快速恢复活力。
3.补施肥料，促进正常生长。待叶尖恢复吐水功能后，及时追肥，促进秧苗恢复生机、多发白根；大田可以根据生长时期补肥，对于孕穗期要追施氮肥起保花作用。
4.加强病虫防治，防止病害。受涝稻田，由于叶片损伤，大大增加感病机会，要及时用药防治。
5.及时排干田间渍水，喷施叶面肥，防治好病虫害。水稻遇洪涝灾害容易引起感染造成病虫害发生率更高，需加强田间管理，补施氨基酸等营养肥料，提高水稻抗病能力。
6.对于中稻和晚稻及时补时恢复肥，增施穗粒肥防早衰。
7.抓好后期病虫害防治，健身栽培，科学施肥，加强田管，综合防治病虫害。
8.对于不同生长期和浸泡时间长短的水稻，要及时排涝，及时补种，加强田间管理，施肥增质（特别是速效有机肥和叶面肥），打药预防病虫害。
9.一般水稻苗期能经得住1-2天的水淹。如果水深超过1米以上，水质混浊，耐淹期会相应缩短。在水稻孕穗期，耐淹期大致不超过12-24小时。