莴苣菌核病主要危害结球莴苣的茎基部或茎用莴苣的基部，在整个生育期均可发病。苗期发病时，病情发展迅速，短时间内可导致幼苗成片腐烂倒伏。发病盛期多出现在生长后期，植株近地面茎基部或接触土壤的衰老叶片边缘、叶柄先受害，病斑初为褐色水渍状，随后发展成软腐状，并在被害部位密生棉絮状白色菌丝体，后期产生菌核。菌核初期为白色，后逐渐变为鼠粪状黑色颗粒状物。病株叶片凋萎，生长不良，呈青枯状萎焉，严重时整株腐烂瘫倒。留种植株发病后期，剥开茎部，内壁可见许多黑色菌核。菌核病引起的腐烂通常没有恶臭，有别于细菌性软腐，但若两病混发时，也会伴恶臭味。菌核病的主要鉴别特征是发病部位软腐，并产生棉絮状菌丝体和鼠粪状菌核。
