辣椒黄萎病的发病盛期主要集中在初夏5月至秋季9月。在春末夏初多雨或梅雨期间多雨的年份,病害发生较为严重。连作地、地势低洼、排水不良的田块发病较早且较重。此外,施用未腐熟有机肥、定植过早、栽苗带土少、伤根多的田块也容易发病。