芹菜软腐病主要危害叶柄基部，苗期染病会出现心叶坏死腐烂，呈烧心状；成株期主要发生在叶柄基部、茎基部和茎上，发病初期出现水渍状淡褐色纺锤形或不规则形的凹陷病斑，后迅速扩展，呈黄褐色或黑褐色，内部组织腐烂并有恶臭味，干燥后变黑色，最后仅残留表皮和维管束，严重时生长点烂掉下垂，全株枯死。芹菜软腐病又称腐烂病，是由胡萝卜软腐欧氏杆菌胡萝卜软腐致病型侵染所引起的、发生在芹菜上的病害。一般发病率在5-10%，严重时可达30%以上。
农业防治技术包括选用优质、高产、抗病品种；加强种子消毒，培育无病壮苗；实行轮作、倒茬，加强中耕除草，清洁园田以压低病原菌及虫口数量，减少初侵染源；利用高温换茬季节，对设施内灌水闷棚，既可淹死害虫，又可洗盐；推广合理密植措施，辅以优良叶面肥使用，增强植株抗病性。加强田间管理，科学施肥灌水，注意病虫害防治工作。