枯萎病在黄瓜的苗期到结果期都有可能发病，以开花结果期间发病率最高。苗期发病时，子叶前期出现不均匀黄化，后逐渐萎蔫下垂，根和茎基部腐烂变褐、溢缩或呈立枯状。成株发病初期主要表现为植株根茎部叶片在中午萎蔫下垂，呈缺水状，早晚尚能恢复，随着病情的加重，不再恢复，植株逐渐枯死。病株茎基部缢缩，表皮多纵裂，湿度大时，皮层腐烂，病部表面出现白色至粉红色霉状物。发病时病株表现为茎基部缢缩，变褐呈水渍状，随后萎蔫倒伏。对病茎纵切时，能发现茎的维管束变褐色。若外部环境湿度参数高，患病植株的表面会呈现粉红色或白色的霉状物，进而根部会逐步腐烂，用手轻轻一拔即可拔下来。
