早春温度偏低、多阴雨、光照偏少的年份发病重；苗床间排水不良、通风不良，光照不足，湿度偏大的发病重；苗床土壤中含有机质多、且施用了未腐熟的粪肥等不利于幼苗根系的生长和发育，也易诱导辣椒猝倒病发生。育苗期应严格控水，浇水时要小水勤浇。土温较低（低于15~16℃）时发病迅速，土壤湿度高，光照不足，幼苗长势弱，抗病力下降易发病。在幼苗子叶中养分快耗尽而新根部尚未扎实之前，由于营养供应紧张，造成抗病力减弱，如果此时遇寒流或连续低温阴雨（雪）天气，而苗床保温不好，会突发此病。猝倒病多在幼苗长出1~2片真叶前发生，3片真叶后发病较少。
