苦瓜蔓枯病主要危害叶片、茎蔓和果实。叶片染病后，初现褐色圆形病斑，中间多为灰褐色，后期病部生出黑色小粒点。茎蔓染病，病斑初为椭圆形或梭形，扩展后为不规则形，灰褐色，湿度大时常溢出胶质物，引起蔓枯，致全株枯死，病部也生出黑色小粒点。果实染病，初生水渍状小圆点，逐渐变为黄褐色凹陷斑，后期病瓜组织易变糟而破碎。危害瓜蔓时，发病轻时茎蔓结合部附近龟裂，严重时造成茎蔓病部表皮黑腐，出现褐色凹陷斑，后茎蔓干枯死亡。蔓上病斑褐色斑，并分泌出琥珀色胶状物，病斑发展至绕茎一周时形成枯蔓。危害叶片时，病斑圆形或近圆形，褐色。危害果实时，初期形成水渍状斑并逐渐下陷，造成果腐。后期病部上会生出黑色小粒点。
