大豆菌核病主要危害成株大豆,导致茎秆变褐枯死。其典型症状包括茎部出现褐色病斑,随后产生白色棉絮状菌丝体及白色颗粒状物,这些颗粒状物最终变为黑色,形成菌核。病株枯死后呈现灰白色,茎中空,皮层常呈现麻丝状。此外,病株外部的菌核容易脱落。