病菌可能在土壤中病残体上越冬，翌年从植株的气孔或伤口侵入。玉米60cm高时组织柔嫩易发病，害虫为害造成的伤口利于病菌侵入。此外害虫携带病菌同时起到传播和接种的作用，如玉米螟、棉铃虫等虫口数量大则发病重。高温高湿利于发病；均温30℃左右，相对湿度高于70%即可发病；均温34℃，相对湿度80%扩展迅速。地势低洼或排水不良，密度过大，通风不良，施用氮肥过多，伤口多发病重。轮作，高畦栽培，排水良好及氮、磷、钾肥比例适当地块植株健壮，发病率低。玉米茎腐病由土壤及作物病残体中的腐霉菌和禾谷镰刀菌侵染引起，病菌从气孔或伤口侵入。玉米灌浆至成熟期的气候条件，特别是雨量与发病关系密切，高温高湿有利于发病，雨后天气转晴，常出现发病高峰。春玉米茎基腐病发生于8月中旬，夏玉米则发生于9月上、中旬，麦田套种玉米的发病时间介于两者之间。
