马铃薯病害主要分为真菌病害、细菌病害和病毒病。其中由真菌引起的马铃薯晚疫病是世界上最主要的马铃薯病害，几乎能在所有的马铃薯种植区发生。通常说的种薯退化即为不同病毒引起的多种病毒病所造成。马铃薯害虫分地上害虫和地下害虫，其中比较主要的有马铃薯块茎蛾、蚜虫等。
马铃薯病害包括病毒病、早疫病、晚疫病、环腐病、疮痂病、软腐病、枯萎病、青枯病、黑胫病、黑痣病（立枯丝核菌病、褐色粗皮病、马铃薯茎溃疡病）、黄萎病、根腐病、粉痂病、白绢病、炭疽病、灰霉病、干腐病、银腐病、小叶病、癌肿病、尾孢菌叶斑病、根腐线虫病。马铃薯虫害有二十八星瓢虫、蚜虫、蓟马、地下害虫（蛴螬、蝼蛄、金针虫、地老虎）、红蜘蛛、豆芫菁、马铃薯块茎蛾。
如果田间已经有中心病株出现，就要抓紧采用药剂控制。当田间出现中心病株时，立即清除中心病株，喷洒1%－2%硫酸铜液，每7天喷1次，连续喷2－3次。病毒病、晚疫病、瓢虫、蛴螬等为马铃薯常见病虫害。马铃薯患病毒病的表现为植株矮小、生长缓慢、叶面卷曲等，发病初期选用盐酸吗啉胍。
枯萎病：播种前，使用40%甲醛溶液150倍液浸种1小时左右，成株期的时候，每亩地使用5g的70%恶霉灵可湿性粉剂兑水10-15kg稀释灌根。