马铃薯黑痣病主要危害幼芽、茎基部及块茎。幼芽染病,有的出土前腐烂成芽腐,造成缺苗。播种时可用25克/升的咯菌腈悬浮种衣剂3.5克/100千克种子进行种子包衣处理。出土后染病初,植株下部叶片发黄,茎基形成褐色凹陷斑。