玉米丝黑穗病主要为害雄穗和果穗，病株会变得短粗，基部顶端会变成球丝，不吐花丝，最后变成黑粉包，成熟后破裂，散出大量黑粉。系统性侵染病害，抽穗后出现典型症状。病果穗短小，不吐花丝，除苞叶外整个果穗都变成一包黑粉，为病菌的冬孢子。黑粉飞散后露出丝状寄主维管束组织。雄穗有时也形成黑粉包，但常常仅个别小穗受害，有时还发现花器变形呈叶片状。病株大多矮小，只有健株的1/3－2/5，偶尔也在剑叶中脉发生条状黑粉堆。有些品种在苗期就明显表现出病态，但未出现症状，故不易识别。染病的雌穗比健穗短，下部膨大顶部较尖，整个果穗变成黑粉包，黑粉飞散后残留丝状寄主维管束组织；也有的苞叶畸形、变窄细、分叉多，子粒重新发芽，呈细长的芽叶状，黑粉少。雄穗染病有的整个花序被破坏变成许多小黑粉包，包膜破裂散出黑粉；有的花器变形增生，颖片增多延长；有的部分雄花序被害变成黑粉包。偶尔侵染叶片，形成长梭状斑，表皮破裂散出黑粉或长出丝状物。在抽穗后症状明显，病株矮小是健株的1/3—2/5，病雌穗短小，下部膨大顶郭小变成黑粉包，成熟后破裂成黑粉，雄穗染病有的整个花被破坏变成许多小黑粉包，成熟破裂成黑粉。主要危害于穗部，整个果穗变成一个黑粉包，内部杂有丝状物。玉米丝黑穗病的典型病症是雄性花器变形，雄花基部膨大，内为一包黑粉，不能形成雄穗。雌穗受害果穗变短，基部粗大，除苞叶外，整个果穗为一包黑粉和散乱的丝状物，严重影响玉米产量。
