根茎部染病，初期病部褐色，湿腐，具酒糟气味，流有胶液。后期如天气干燥，病部常干裂，条件适宜时，病斑迅速扩展，严重的环绕整个树干，致橘树死亡。脚腐病主要发生于主干基部，引起皮层呈不规则的黄褐色水渍状腐烂，有酒糟气味，颜色变褐，常渗出褐色胶液。温暖潮湿时，病部不断向纵横扩展，向下蔓延至根群，引起主根、侧根腐烂。向上蔓延一般不超过离地面30厘米，当病斑向四周扩展，可使根颈部树皮全部腐烂，最终导致植株死亡。病树部分大枝上或整个树冠叶片的中脉及侧脉呈黄色，引起叶落、枝枯，树势衰弱，开花多，花期短，结果少，所结的果实着色早，皮粗味酸。果实发病时，先为圆形的淡褐色病斑，后渐变成褐色水渍状。病健部分界明显，只侵染白皮层，不烂及果肉。干燥时病斑干韧，手指按下稍有弹性；潮湿时则呈水渍状软腐，长出白色菌丝，有腐臭味。发病严重的果实不久即脱落。起初部分侧根发病，会致使水分与养料供给不足，导致地上部分的树势渐渐衰弱，果品与产量大幅下滑。主根及大的侧根全部感病腐烂后，则根的功能完全丧失，树体因缺乏水分与养料的供给而死亡。果园发病初期出现零星死树，发病时间越长死树越多，严重时，果园柑橘树成片死亡、果园毁灭。病原菌：怀伞菌、小蜜环菌和致病力强的寄生疫霉。
