叶枯病、细菌性软腐病、大蒜菌核病、疫霉根腐病、疫病是大蒜种植过程中常出现的病害种类。主要虫害有葱地眼蕈蚊(蒜蛆)、韭Extended眼蕈蚊(韭蛆)、刺足根螨、蓟马、斑潜蝇等。刚采收的大蒜头不能曝晒，否则蒜头容易变软，俗称“糖应”。
