早施苗肥有利于芝麻根系能够早期吸收养分，利于苗其生长。芝麻要结合早间苗、早定苗，看苗早施一次以速效性肥料为主的苗肥，施好苗肥是芝麻早发健长的重要措施。因为种子较小，加上往往底施氮肥施用过多，容易使幼苗旺长，形成高脚苗。及时施苗肥促进幼苗健壮生长，是保证增花、多蒴、高产的重要措施。施肥最好在出芽开始以及开花和结果期结束时进行追肥。第一开花期的追肥主要是为了促进花蕾的分化，为多结打下基础。在出芽期和开花初期，每亩约施用8-10kg硫酸铵和过磷酸钙，混合施用比不追施可使产量提高10％以上，开花期和果实期结束时追肥可以防止后期的去精，减少黄梢或空斑，使种子更饱满，并增加谷粒重量。
