鲜果采回后，倒入沸水中煮5～10分钟，当果皮开始转色并稍变软时捞出滴干。之后晾晒1～2天至外皮皱缩后，用刀纵切成2瓣，大果可切成3～4瓣，然后放在草席上仰晒3～4天，使瓢内水分晾干，颜色变红时，再翻晒至外皮发皱，呈紫红色即可。天气较好的，可以白天晒，晚上在露天中晾，直至晒干，如此木瓜色泽呈赤褐色，质量上乘。阴雨天可用文火烘干。传统的加工方法，所用的切刀以铜质最好，如用铁质刀具切果，往往果肉容易变黑，影响药材质量等级。将晒干的木瓜片用干净的麻袋或竹篓盛装，放在通风干燥处保存，并做好防潮、防霉变和防虫蛀。
