番茄灰霉病是由中低温度高湿度下灰葡萄球菌侵染引起。防治方法包括：
1.科学放风：上午棚内温度达到27-28℃时，等果实表面的露珠消退后开始放风，可有效减少果面环裂现象的发生。遇到大风天气时，要避免风直吹西红柿果实，最好是喷施新高脂膜形成一层高分子膜，可有效减少环裂。
2.均衡肥水：西红柿进入膨果期后，根据棚室土壤墒情，及时追肥浇水，并配合使用光合营养膜肥，可助力吸收大量光肥、光能、光照、兼容常规肥料、养料供给植物生长发育至极限。浇水保证不过干过湿，不大水大肥。
3.喷药时间：喷药时若棚内温度偏高或喷药时间安排在中午，药液挥发快，致使果面残留的药滴浓度迅速变大，在药物的刺激下，果皮也容易生裂口，形成环裂。
4.栽培措施：及时清除病果及病残体，集中烧毁、深埋，减少初侵染源。与非茄科作物实行2年以上轮作。
5.药剂防治：发病初期开始喷药，每667平方米每次用50％乙烯菌核利干悬浮剂（农利灵）75-100克，加水100千克稀释成1000-1300倍液，进行茎叶喷雾，每间隔7—10天喷l次药，共喷药3-4次。常用药还有75％百菌清可湿性粉剂500倍液，50％苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，50％多菌灵可湿性粉剂500～600倍液，36％甲基硫菌灵悬浮剂500倍液。每隔7—10天防治1次，连续防治2-3次。
6.种子臭氧灭菌处理：在育苗下籽前，用臭氧水侵泡种子40-60分钟。
7.大剂量臭氧空棚灭菌：在幼苗移栽前，关闭放风口，用大剂量臭氧气体对空棚进行灭菌处理。
8.采用RTBF-300病害防治机，对密闭的温室空间空气进行自动化定时量化臭氧灭菌。