大葱常见病虫害有地蛆、红蜘蛛、葱紫斑病、软腐病、线虫病、葱蓟马、葱锈病、霜霉病、黑斑病、潜叶蝇、葱蝇、甜菜夜蛾等。大蒜的主要病害有叶枯病、紫斑病、细菌性软腐病、大蒜菌核病、疫霉根腐病、疫病等;主要虫害有蒜蛆、韭菜迟眼蕈蚊(韭蛆)、蓟马等。