种植密度大，株、行间郁敝，通风透光不好，发病重。氮肥施用太多，生长过嫩，抗性降低易发病。土壤黏重、偏酸；多年重茬，田间病残体多；肥力不足、耕作粗放、杂草丛生的田块，地下害虫严重的田块发病重。种子带菌、肥料未腐熟、有机肥带菌或肥料中混有本科作物病残体的易发病。地势低洼积水、排水不良、土壤潮湿、含水量大，易发病；温暖、高湿、多雨、日照不足易发病。尖孢镰刀菌在土壤中或病残体上越冬。立枯丝核菌不产生孢子，主要以菌丝体传播和繁殖。两种病原在土壤中遇到适宜温湿度即可侵染果实，多由伤口侵入。茄果腐病根据病原可分为镰刀菌果腐病和丝核菌果腐病：番茄果实感染镰刀菌果腐病后，主要为害成熟果实。果实发病初期表面出现淡色斑，逐渐变为褐色，病斑形状不定，没有明显的边缘，后扩展遍及整个果实。有伤口时多先从伤口处发病。湿度大时，病部密生略带红色棉絮状菌丝体，引起果实腐烂，大多脱落。
