生菜软腐病常在生长中后期或结球期发生，多从植株基部伤口处开始侵染。初呈浸润半透明状，随后病部扩大成不规则形，水渍状，充满浅灰褐色粘稠物，并释放出恶臭气味。随病情发展，病害沿基部向上快速扩展，使菜球腐烂。有时，病菌也从外叶叶缘和叶球的顶部开始腐烂。
生菜根腐在茎基部产生白色菌丝，后形成白色颗粒，其上溢有水滴，小颗粒再变为黑色菌核，有时菌核连成块状，导致根部腐烂。生菜茎基腐初在茎基部发生病变，幼嫩生菜先染病，菌丝从植株下向上扩展，速度快，病株软腐而倒伏并散发出恶臭味。
病原菌会从生菜的根基部开始侵染，且多从伤口进入，这些伤口可能是被害虫咬伤的，也有可能是田间管理时人员不小心磕碰到所造成的损伤。初侵染时，被感染处会变得半透明，有水润润的感觉。随着侵染的深入，感染区会迅速扩大，并溢出一些浅灰褐色的粘稠液体，凑近去闻的话，可以闻到一股明显的臭味。到了后期，病区会沿茎干向上走，并发展到叶片以及结球生菜的菜球。被感染的叶片，会从边缘部位向里腐烂，而被感染的菜球，则会从顶端向下向里腐烂。