西葫芦病毒病的危害时间较长,幼苗期到成株期均可染病。幼苗期感病,叶片出现绿色斑点,有明脉现象,植株矮化,较为严重时叶片变形呈鸡爪状,叶片失绿起皱并出现蕨叶。成株期感病,植株容易落花导致结实率降低,有的植株会结实,但所结瓜体表面出现肿瘤或黑色斑点,严重影响其外观和口感,还会危害人体健康。此外,感病后,果实在未成熟时比较容易掉落。叶片发病后,出现淡黄色不明显病斑纹,后变为深淡不均的花叶病斑。有的新叶片出现浓绿色隆起皱纹,叶片变小、裂片、黄化,严重时植株死亡。瓜生病时,瓜表面出现花斑或凹凸不平的瘤状,瓜畸形。