玉米细菌性茎腐病的发生与气候条件密切相关，特别是在高温高湿的环境下。当平均气温达到30℃左右，且相对湿度超过70%时，该病即可发生。若平均气温升至34℃，同时相对湿度达到80%，则病情会迅速扩展。此病一般出现在玉米生长的抽雄期至灌浆期。
