炭疽病是朝天椒常见病害,主要危害果实、叶片、茎和果柄。病菌发育温度范围为12-33℃,高温高湿有利于此病发生。如平均气温26~28℃,相对湿度大于95%时,最适宜发病和侵染,空气相对湿度在70%以下时,难以发病。病菌侵入后3天就可以发病。地势低洼、土质粘重、排水不良、种植过密通透性差、施肥不足或氮肥过多、管理粗放引起表面伤口,或因叶斑病落叶多,果实受烈日暴晒等情况,都易于诱发此病害,都会加重病害的侵染与流行。炭疽病一般发生在高温多雨的天气,生长瘦弱的植株及将近成熟的果实容易受其害。朝天椒果实若发生此病,将形成白皮壳、黄皮壳,降低品质。果实染病,初现湿润状、黄褐色椭圆形或不规则形病斑,稍凹陷,斑面出现明显环纹状的橙红色小粒点,后转变为黑色小点,此为病菌的分生孢子盘。天气潮湿时溢出淡粉红色的粒状粘稠状物,此为病菌的分生孢子团。天气干燥时,病部干缩变薄成纸状且易破裂。在田间还有一种病果,症状与上述相似,但在斑面上产生的黑色粒点较大、色深,常称为黑点炭疽病。