西葫芦霜霉病的防治主要有农业防治和化学防治两个方面。蔬菜防治原则以预防为主，综合防治。农业防治方面，重施基肥（有机肥）、合理通风排湿、温湿度调控、巧施冲施肥及叶面肥，增强抗性；生物防治可采用枯草芽孢杆菌等生物杀菌剂预防；化学防治尽量使用高效低毒的烟熏剂，如百菌清。
具体措施包括：1、选用抗病品种，采用膜下暗灌和滴灌，加强通风，降低空气湿度。温室、大棚内白天温度以28～32度为宜，控制病害发生。发病初期可用45%百菌清烟剂200~250克，傍晚时在温室内多点堆放点燃，熏蒸防病。2、使用5%百菌清粉尘剂或10%防霉灵粉尘剂，每次每666.7平方米用药1千克，每10天喷1次。也可用40%三乙膦酸销250倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液或25%甲霜灵可湿性粉剂600～800倍液，每隔7～10天交替用药喷1次，均有防治效果。
药剂防治可用三乙膦酸铝、甲霜灵锰锌、甲霜灵、瑞毒霉、杀毒矾、乙磷铝锰锌、克抗灵、克露、克霜氰、霜脲锰锌、百菌清等喷雾。保护地可烟雾熏治，每667平方米每次用45%百菌清烟雾剂200-250克分堆放置，点燃后闷棚，一般于傍晚开始，次日早晨结束。