西瓜蔓枯病的防治方法包括加强栽培管理，平整土地，排灌畅通，防积水，合理密植。及时整枝，加强通风透光，使用生物有机肥，提高作物抗性。发病初期可用75%百菌清800倍、50%拌种双500倍、2%菌毒克毒300倍液喷雾防治，隔5~7天一次，连续2~3次。此外，发病初期还可使用咪酰氨锰盐或者络安酮原液涂抹西瓜藤蔓开裂处或柠檬酸酮灌根；使用百菌清300倍液喷施整地植株，以及36%的多菌灵500倍液，或者40%的双弧三辛烷基苯磺酸盐1000倍溶液喷施，对西瓜蔓枯病初期症状有很好的防治作用。西瓜枯萎病多采用农业防治措施进行提前预防，一旦发病药物防控效果不好，发病初期可用甲基托布津十枯萎灵灌根喷雾防治。
