辣椒病毒病由多种病毒侵染引起，症状复杂多样，常见的有以下4种类型：
花叶型：初期叶脉轻微褪绿，出现浓淡相间的花叶斑纹，植株无明显矮化，不落叶，也无畸形叶片。严重时叶脉皱缩，叶面凹凸不平，生长缓慢。植株矮化，果实瘦小并出现深浅不同的纹斑，僵化，难以转红。
黄化型：病株从嫩尖幼叶开始变黄，随后大量落叶、落花、落果。
坏死型：病株部分组织坏死，表现为斑点、条斑、顶枯、坏死斑驳及环斑等，严重时造成落叶、落花、落果，甚至整株枯死。
畸形：病株变形，节间缩短、矮化，枝叶丛生，叶片增厚，变小或呈线状，病果黄绿相间，不平整，易脱落。病叶呈现浓绿与淡绿相间的花斑；皱缩、叶片畸型：初期由心叶叶脉褪绿，逐渐变为花叶皱缩，以后病叶增厚，叶缘向上卷曲形成斗状，幼叶狭窄或出现线状叶。后期植株上部明显丛簇状，节间缩短，植株矮化，重病果出现深绿相间的花斑，有疣状突起。
发病条件一般是有传播媒介即刺吸式口器的害虫，如蚜虫、灰飞虱、白粉虱、烟粉虱等，也可通过农事操作传播。空气相对干燥有利于病毒病的发生。
防治措施包括选用抗病品种，培育壮苗，种子消毒，加强田间管理不连作，防治蚜虫减少侵染机会。选用高效、低毒、环保型农药，精准施药，合理施肥，提高植物抗逆性；应用性诱剂诱捕螟虫，降低害虫基数，逐步实现农药减量、农产品增收的效果。