辣椒绵腐病在苗期即可发生，引起幼苗基部腐烂、缢缩而死亡。成株期主要为害果实，病部褐色湿腐，湿度大时病部长出白色致密絮状霉层，重时整个果实发病最后腐烂。加强对棉铃虫等蛀果害虫的防治，蛀果害虫会在果实上造成伤口，引发病害。可用5%功夫乳油5000倍液，或20%多灭威2000～2500倍液，或4.5%高效氯氰菊酯3000～3500倍液杀菌农药防治。雨前雨后及时喷洒72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，或嘧啶核苷类抗菌素1000倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、77%可杀得101可湿性微粒粉剂500倍液、38%恶霜菌酯水剂800倍液。
