病菌主要在种子和土壤中的病残株上越冬，成为翌年的初次侵染来源。在田间主要靠雨水、风、农具等传播。多雨潮湿年份，特别是收获期遇雨，收获后的种子带菌率很高。花生自出苗至收获都能发病，苗期雨水多、土壤湿度大时发病较重。大雨之后骤晴，气温回升快时发病较重，温度过高过低均不利于此病的发生。当5厘米地温稳定在23~25°C，空气相对湿度在60%~70%时，利于该病发生。
病原为棉色二孢，属半知菌亚门。分生孢子器球形，黑色，埋生。分生孢子梗不分枝。分生孢子无色，椭圆形，单胞，成熟后黑褐色，双胞。子囊座黑色，丛生，子囊孢子无色，单生。
花生茎腐病发病条件：病菌主要在种子和土壤中的病残株上越冬，成为第二年发病的来源。病株作为饲料或荚果壳饲养牲畜后粪便，以及混有病残株所积造的土杂肥也能传播蔓延。在田间传播主要靠雨水径流，其次是大风，农事操作过程中携带病菌也能传播。多雨潮湿年份，特别是收获季节遇雨，收获的种子带菌率较高，不仅是病害的主要传播者，还能通过引种远距离传播。