西红柿灰霉病可用百菌清+磷酸二氢钾喷雾防治。番茄进入开花结果期后，灰霉病也进入危害盛期，开花后，要及时摘除果实蒂部的残花，浇水采用膜下灌水或滴管，加强通风排湿，降低棚内湿度。同时番茄灰霉病是一种低温高湿型病害，可在低温连阴雨天气，用15%腐霉·百菌清烟剂，或15%异菌·百菌清烟剂200～300克/亩。将烟雾剂横放在地上或横向悬挂，自棚室深处逐一向外点燃，点燃烟剂后施放者应迅速离去，闷棚一夜后第二天放风。
加强田间管理，科学施肥灌水，做好病虫害防治。灰霉病在西红柿上的化学防治用腐霉利或者嘧霉胺悬浮剂喷雾防治。加强栽培管理，实行轮作，栽种前进行土壤消毒，同时用65%代森锌可湿性粉剂300～400倍液将种苗浸泡10～12分钟然后再栽种。栽植时不宜过密，生长期间不要偏施氮肥。盆栽宜每年换一次新的培养土。发病初期及时摘除病叶、枝、芽和带病的花蕾，然后喷洒50%代森铵800～1000倍液。喷药重点除患部外，还有土壤表面。每隔15天左右喷一次，连续喷2～3次，即能取得良好防治效果。选用优质的抗病品种，合理的水肥管理，病虫害的防治。