在农机股份合作制中，投资分配与按劳分配是相辅相成的。投资分配依据农机股份合作社中的股份比例分配经营收益，体现了按股份分配的原则。按劳分配则根据个人或团队的劳动贡献分配经营收益，体现了按劳动力分配的原则。这两种分配方式共同存在，相互促进，确保了分配公平，激励了农机合作社成员。
要妥善处理投资分配与按劳分配的关系，首要任务是建立科学合理的分配机制。农机合作社应根据成员的投资金额和股份比例，明确投资分配规则，确保投资者按其投资比例分享经营收益。同时，应制定按劳分配规则，奖励那些为合作社做出更多劳动贡献的成员。此外，还需建立监督机制，确保分配规则的公正透明，防止滥用职权或恶意侵占经营收益的行为发生。
此外，加强培训与教育同样关键。通过培训，提升农机合作社成员的经营管理能力和劳动技能，使其更好地参与经营活动，为合作社的发展贡献力量。教育还能增强成员的分配意识与责任感，让他们理解并支持投资分配与按劳分配的结合，为分配规则的有效执行提供坚实保障。