畜牧业的生产特点决定了农村农机补贴对其帮助有限。相较于植物性农业，畜牧业需要更多的人力投入和管理，如饲养、养殖、疫病防治等。农村农机补贴主要针对农机设备的购置和使用，与畜牧业关联性较低，对其效益提升作用不明显。
畜牧业生产的关键在于饲养管理和疫病防治等技术知识。农村农机补贴未涉及这些方面，而畜牧业发展更需要技术支持和培训，以提高从业者的专业水平。农机补贴对畜牧业的帮助相对较小。
此外，农村农机补贴存在城乡差距问题。资源和政策分配不均使畜牧业薄弱地区获得的补贴支持有限，制约了这些地区畜牧业的发展。