正确地进行水泵的运行操作、维护是机组保持正常运转，提高效率的重要措施。
起动前的准备包括：检查机组是否固定良好，各部位螺丝是否松动；确认两轴是否同心，间隙是否合适；检查联轴器或皮带轮转动是否灵活，叶轮有无摩擦声；确保润滑油充足和干净；调整填料压盖的松紧度；检查进水口有无杂物堵塞，底阀或轴流泵的叶轮浸没水中深度是否合适；需要灌水的水泵起动前要灌满水，出水管路上有闸阀的在开车前必须关闭；轴流泵起动前需灌水润滑橡胶轴承。
起动和起动后的工作包括：起动动力机，对于无闸阀的小型离心泵可直接起动抽水；安有闸阀的大型离心泵开始转速要慢，逐渐加快至额定转速；待水泵旋转正常转速后，旋开真空表和压力表的阀门，观察其数值是否正常；如正常可将出水闸阀逐渐开到最大值；机组转速稳定至开动闸阀之间的时间不得超过3——5分钟。
水泵在运行中应随时注意检查机器运转声是否正常，各种仪表工作是否正常，水泵流量是否正常，填料处滴水是否正常，水泵和水管各部分有否漏水漏气情况，轴承温度是否适宜，吸水池水面是否下降以及适时擦上一些皮带油。