北方农业耕作机械化存在的问题包括部分农民观念未转变、地理环境制约和相关部门投入不足。许多北方农民仍依赖传统耕作方式，对新式农业机械技术了解不足。地理环境如丘陵和高原地形限制了机械的广泛应用。此外，政府补贴虽存在，但不足以覆盖所有农户的购机及维护成本。
为解决这些问题，首先需建立完善的政府支持体系，通过示范性工程推动旱作农业的现代化。其次，应落实农机购置补贴政策，确保资金公开透明，防止滥用。最后，加强乡镇基层组织建设，确保农业技术推广的有效实施。
总之，将现代农业机械与北方农业耕作结合，是推动北方农业经济发展的关键。需要国家、地方和农民共同努力，解决现阶段问题，促进北方地区农业现代化及城乡一体化发展。