水田耕整机在出厂时是分件包装好的，使用前需进行组装（可请有经验的机手指导）。组装后，必须对整机进行全面检查。
首先，检查螺栓或用插销连接的部件连接处的松紧程度。如发现发动机机座、皮带轮、驱动轮转向架、后支承板、牵引架与齿轮箱、升降杆套与升降轴等连接处的螺栓有松动，应拧紧。用销轴连接的地方应连接可靠，要求上插销的不能遗漏，以防松脱。各活动部位每班作业前应滴适量机油，使其活动自如。
其次，起动前应检查发动机机油、燃油与齿轮箱机油。齿轮箱的机油应加注至齿轮箱前窗最下螺栓孔，以有油溢出为准。
最后，新机或大修后的机器需进行磨合试运转。因耕整机的运动部件如齿轮箱的齿轮，其工作表面虽经精密加工，但仍留有微观的凹凸不平。若一开始就全负荷工作，会使运动零件很快磨损或损坏，大大降低使用寿命。因此，使用前必须经过磨合试运转，目的是通过缓慢提高速度、逐渐增加负荷，使运动零件表面的微观凸起部分逐渐研磨平滑、改善润滑条件，延长机器寿命。磨合方法可与柴油机的磨合同时进行。磨合结束后，定要放出齿轮箱内的旧机油（可用容器盛好进行处理），换上新的或经处理好的机油，方可进行作业。