在拖拉机的维修保养中，除了进行外部和内部的清洗工作外，还需特别注意滤清器、冷却系统及润滑系统的清洁。
泡沫塑料空气滤清器的清洗
首先，清除滤清器壳内的尘土。将滤片放入洗衣粉或皂水溶液中轻轻揉洗（切勿使用汽油），洗去污物后晾干。接着，将滤片浸入清洁机油中充分浸透，再用手挤干。若更换新滤片，也需浸泡机油。新滤片宽度应比芯管高10毫米，两端各超出芯管5毫米，并确保缠绕两圈，两端压在压条下方，外露部分不超过3毫米。安装时，滤片缠绕方向应与空气流动方向一致。
纸制滤芯的清洗
先用橡皮塞堵住滤芯两端的中心孔，将其放入盛有柴油或煤油的盆中，用软刷清洗内孔。随后，通过打气吹出滤纸表面微孔内的污物，最后再用干净的柴油或煤油刷洗一次。
冷却系统的清洗
1.酸洗法：放净冷却水后，灌入25%的盐酸溶液，静置10分钟后水垢脱落、溶解，随后放出清洗液，并用清水彻底冲洗冷却系统。若放水开关堵塞，可取下下方水管排出清洗液。
2.碱洗法：放净冷却水后，将6千克热水、0.5千克烧碱和0.1千克煤油混合液倒入水箱，静置2小时。启动发动机运转10分钟，重复5-6次后趁热放出清洗液，稍冷后用清水冲洗水箱和水道。
润滑系统的清洗
发动机停转后，趁热放出旧机油以排出杂质，随后清洗滤清器和放油塞。在曲轴箱内加入由机油、煤油和柴油混合而成的洗涤油，低速运转发动机3-5分钟，放尽洗涤油后注入新机油。清洗过程中，确保机油压力不低于50kPa。
变速箱的清洗
趁热放出齿轮油，加入适量柴油，使拖拉机前进、倒退数次进行清洗。随后放出柴油，加入清洁的齿轮油。