南瓜是雌雄同株，每株苗上有雌、雄花两种花，当然只有雌、雄花传粉受精后，雌花才能结果。
剥去雄花的花瓣，将雄花的花蕊在雌花的蕊柱上轻轻涂抹，使花粉粒粘附在柱头上，就完成了授粉的过程。注意：如果不是在开花当天授粉的话，雄花就会失去授粉的功能。而人工授粉最好选在上午，此时是雌、雄蕊生长最旺盛的时段，授精率高，生命力强。自然界中，雄花完成传粉受精作用就脱落了。雄花又俗称谎花，就是因为光开花不结果。
如果南瓜种植的地方有多种南瓜，或者不想自己种植的南瓜有杂交的情况出现，就要及时对南瓜授粉，否则可能会被勤劳的蜜蜂进行授粉而产生杂交现象。